A ver si lo entiendo bien, los 2 discos son:
-SSD Apacer M2 PCIe
-SSD Samsung 860 evo, con conector Sata.
Ya que el Samsung 860 Evo esta tanto en M2 como conector Sata, ambos siendo Sata.
Ambos tienen la misma capacidad?
Si te hace falta espacio, por que elegir? Podrías dejar ambos instalados si tienen conectores diferentes.